母免遭炮火和鱼雷的袭击。据计算，该艘航母可抵御6400米（7000码）以外的巡洋舰15.25厘米（6英寸）口径火炮的炮火从2137米高空所投掷的227千克（500磅）重的炸弹，以及340千克（750磅）重的鱼雷弹头的打击，不会受到损害。

    该级航母建有两个机库，它们均设有通风条件较好的通风口，并且配备了精良的防火设施，其中包括钢板门、海水喷洒装置和防止燃油蒸汽扩散到机库外部的气塞。但这些装置也带来了负面影响，当航母的设计方案最终确定时，舰载机的数量已经从70架减少到60架。与美国和英国的早期航空母舰不同，“皇家方舟”号的飞行甲板是钢质的，它的前、后两端都有一个下倾斜坡。早在一战末期，从对“暴怒”号和“鹰”号模型进行风洞试验开始一直到现在，英国一直关注着空气动力学的因素。就连“皇家方舟”号的上层建筑也被设计成机翼形状，这种设计对于保证舰载机的正常起降非常必要。然而，由于美国海军飞机都很坚固，因此，航母岛型上层建筑的形状问题基本上没有引起人们的注意。“皇家方舟”号与“列克星敦”号和“萨拉托加”号有一点非常相似，它们的飞行甲板构成了船体上部的“坚硬”甲板或船体的上层主梁，这种设计的可行性是通过避免在航母的侧面开口来实现的，而对于开放式机库的概念来讲，在侧面开口是一种最基本的要求。由此，这就引出了另一个问题：航母只能配备相对较小的升降机，以避免开口穿透航母主梁。此外，分别位于航母前部和后部右舷的两个升降机只有6.7米（22英尺）宽，另一个位于岛型上层建筑对面靠近左舷的升降机可使飞机在机库周围自由移动。然而，英国却在这一方面弄巧成拙，每个升降机都有上、下两个平台，以便将飞机从下机库维修间提升到上机库，但在将受损飞机从飞行甲板运送到下层机库之际，升降机运行速度就显得缓慢而且笨拙。另外，由于起重机过于狭窄，在上下运送之前，飞机机翼必须折叠起来。该艘航母的飞行甲板前端安装两个液压弹射器，它们与“约克城”号航母上的弹射器不同，与其说它们是一种真正意义上的弹射器，还不如说是一种加速器。美国的舰载弹射器都是将飞机直接弹射出去，而“皇家方舟”号则要求先将飞机吊放在一辆有轨电车上，然后让电车以66节的速度向前推进。航母上还设有8条拦阻索和一张安全防护网，这是英国航空母舰第一次配备这些装置。