学派的卫生学与热带疾病医学家恺文·德孔克提出了反驳，他指出，埃博拉的一个主要症状是大量出血，而这个特点在修昔底德的陈述中完全没有被提及。两年后，美国国家癌症研究所一个专门从事黑死病研究的小组于1998年发表研究报告，以另一角度提出了自己的观点。他们认为，从症状上看可以肯定雅典瘟疫与中世纪的黑死病均因感染了同一种出血性病毒所致，因而极有可能就是黑死病，但要断定这种病毒是埃博拉病毒还缺少依据。

    雅典瘟疫病因到底是什么？《剑桥医学史》概括地说：“根据修昔底德所描述的症状，鼠疫、天花、麻疹、斑疹伤寒，甚至梅毒以及麦角中毒都可能榜上有名。无论哪种疾病似乎都已经破坏了希腊人通过中和与免疫而控制其发病的能力。”尽管出现了种种专家十分认可的猜想，但能否最终探明雅典瘟疫的病因，美国芝加哥大学的历史学荣誉教授麦克尼尔却对此从不抱乐观态度。他在《瘟疫与人：传染病对人类历史的冲击》中就这样写道：“雅典瘟疫，这种病没法在现代医学中被确认，假使修昔底德的话可信，那将是一种新疾病，而且它的消失也和它的出现一样神秘，神秘的传染病来了又走了，不留一丝痕迹。”

    这场可怕的瘟疫匆匆而来，又神秘消失，可供后世考证的史料少得可怜，我们只能从修昔底德的只言片语中大致地猜测它发生时的状况，但却无法考证它的来源和消失的真正原因。这场可怕的雅典瘟疫就这样神秘消失了，留给后世医学界和史学界的却是无数的谜团。