了不少人，在湖南受到别人诬陷，原本挪用公款的永州总兵樊燮向湖广总督状告他私役兵卒，此事被捅到了朝廷。咸丰十年（1860），左宗棠被传唤到武昌对质，引起了轩然大波。咸丰帝为了肃清不正之风，甚至交代湖广总督：“如左宗棠有不法情事，可就地正法。”湖南巡抚骆秉章与湖北巡抚胡林翼都纷纷为其求情，认为左宗棠“名满天下，谤亦随之”。后在诸多官员的担保之下，咸丰帝才放过左宗棠一次。

    受到这一波折之后，左宗棠逐渐看到了官场险恶，他辞别骆秉章，颓然地回到湖北襄阳，打算从此委身江湖，远离庙堂，再也不去过忧谗畏讥的日子。而当时曾国藩正率领部队在宿松，听闻此事后便接左宗棠到自己的大营之中暂避锋芒，并时常与他探讨军情。

    同年四月初一，朝廷向曾国藩特旨询问：“目下贼氛甚炽，而湖南亦所必欲甘心，应否令左宗棠仍在湖南本地襄办团练等事，抑或调该侍郎军营，俾得尽其所长，以收得人之效？”接到这一旨意之后，曾国藩立刻回复朝廷：“左宗棠熟悉湖南形势，战胜攻取，调度有方，刚明耐苦，晓畅兵机，当此需才扎亟之际，或饬令办理湖南团防，或简用藩臬等官，予以地方，俾得安心任事，必能感激图报，有裨时局。”四月二十，清廷接到了曾国藩的奏章，随即任命左宗棠“以四品京堂候补，随同曾国藩襄办军务”。而曾国藩则让左宗棠回到湖南招募湘勇奔赴江西，几个月后，果然连克德兴、婺源，建立军功。十一月二十八日，曾国藩专门撰写奏折，为左宗棠请赏：“臣查左宗棠一军，自移师景镇，一闻贵溪警报，分路调拨，迎头痛击，实属调度神速，将士用命。左宗棠初立新军，骤当大敌，昼而跃马入阵，暮而治事达旦，实属勤劳异常。”经此奏折推举，咸丰帝对左宗棠的态度也大为改观，将其晋升为三品候补京堂。