□ 战略控制
对招商局投资相对控股或战略投资的企业，招商局均强化了战略控制，例如旗下的招商银行，在当初上市的策划中，招商银行行长马蔚华的理想是构筑一个统一的“全金融”平台上市，除了商业银行业务外，还通过一家名为“新江南”的公司搞了非商业银行业务，包括通过它持招商证券和长城证券大股。同时，还有好几家保险公司在和招行谈合资保险公司，招行下面还有基金管理业务。
秦晓到任后不久，和招行的上市保荐人中金公司、马蔚华等人第一次坐在一起开会。秦晓听了情况介绍后，马上抛出他的观点：他坚决不同意招行以“全金融”概念上市，一定要将非商业银行业务和招行剥离开，后者单独上市。理由一，搞“全金融”，不确定性太大；二，目前为止，市场无法看到招行统一金融平台的优势在哪里，业内也没有一家综合金融平台证明了一加一是大于二的，相反，把证券和保险拉扯进来倒有可能降低市场对招行商业银行业务的评价，与其这样，还不如把几家分开独立上市更好；三，如果不抓紧时机上市，将不良资产一并剥离，不良资产越积越多，日后难以消化，原来招行所取得的成绩，比如资本充足率等各项还算良好的财务指标都不能得到巩固。
此前，秦晓并未就此与马蔚华沟通过，马蔚华见到秦晓此番表态，自然大感惊诧，表示不能接受，不过中金公司却立即表示赞同。后来，这场会议被称之为招行上市中具有转折意义的“遵义会议”。
马蔚华想不通，私下去找秦晓。秦晓和马蔚华谈了很长时间，谈了很多次。“你们有一种‘新江南’情结!”秦晓半开玩笑地对招商银行管理层提出批评时，马蔚华等人也笑了。也许是秦晓的下一句话最终说服了马蔚华们：“招商局现在把‘新江南’买走，再和你签一个回购协议，什么时候政策允许了，董事会认为可以搞了，你再买回来。” 制定好整体战略后，作为招商银行董事长，秦晓又去说服那些不愿意承担剥离不良资产代价的老股东。有股东一要求分当年的利润，二又希望招行能够上市。秦晓明确告诉他：“你的立场是不能两全的。招行要想上市，老股东必须要付短期代价。”为此，招行上市前剥离60亿元不良资产，2002年4月顺利上市后，换来了109亿元的发展资金。
招商局虽然很有兴趣走中信统一金融平台之路，但在保险、保险经纪、基金管理等诸方面的投资规模都比较小、比较分散。例如，招商局早在1988年就参股创立了平安保险，但仅以14.37%的股份比例占据第二大股东的地位。在发现向第一大股东深圳市投资管理公司购买股份成本太高以后，就坚决将所有股份卖出，虽然平安保险也即将推出上市计划。
平安保险是招商局在保险业创出的一个品牌。但是，秦晓认为：“我们能主导它，它就是我们的主营，我们不能主导它，它就不是我们的主营。话语权不够大，是我们做出卖平安股权决策的依据。”
目前,招商局正在选择美国的保险公司来合作，在保险业重新打造一个核心品牌。秦晓特意补充道：“这将是我们能主导的。”
而对另一家优秀企业集装箱制造商中集集团，虽然并不在招商局的核心产业中，和平安保险一样，也属于招商局的“投资性业务”，但是秦晓明确表示，招商局会继续维持在中集的大股东地位。这其中一个重要原因就是招商局仍在中集占有27%的股份，在中集有相当的话语权。比如中集提出想收购造船厂进入造船业务，招商局否决了这一战略方向，却支持他们优先发展半挂车。
□ 绩效标杆
漳州会议过后，招商局整个集团只保留两个层级，一个总部，一个子公司，从前处于两者中间的层次，比如运输集团、科技集团都被撤销。船运、科技、工业等被排斥在核心产业之外，它们或者在招商局历史上有不可忽略的地位、或者至今还在向集团贡献着相当数量的利润。
秦晓清楚子公司的小利益必然会与集团公司的整体利益冲突：“谁都愿意当核心产业。每个局部都有他自己的利益和道理，他的道理在他自己的小范围里是成立的，但放在大框架底下就不一定成立。”
招商局在北京有家交通进出口公司(简称“交进”)，它的一个重要业务是做造船业务的代理。交进在这个行当经营时间比较长、人才比较专业、客户信誉也不错，每年都有几千万的利润，但是总部在判断这项业务的时候觉得它的风险太大，因为每造一条船它都要作担保，担保总额度最高的时候接近十亿元人民币。秦晓去和财务部谈完后结论认为，这不是招商局的主营业务，不应该为此冒这么大的财务风险，一旦哪个单子失手，就会危及整个公司。为此，总部调整了交进的绩效指标，保持一定的市场份额，但最重要的是，两年之内要把公司的担保总额逐年下降到三四亿元人民币的量。但这个要求遭到交进管理层的抱怨，说如果取消担保，就不能做大船的规模，就会失去市场、失去客户。但招商局总部既已下决心要压这个担保，而且把此项内容纳入对经营者的考核，也就拒绝了交进管理层的讨价还价。
“其实两年之后他们的业务还在增长，还开辟了一些新的业务，像投标业务，但是财务风险降下来了。如果当初光听他给你讲出的很多道理，你就下不了决心。其实每项决策都是有利有弊的，你必须给出(总部)自己的判断，而且通过你的协调功能，使它完成这个转换。”秦晓说。
招商银行上市以后，招商局也制定了对招行的新战略与绩效指标：规模、质量、效益、结构要协调发展。秦晓说：“单从效益来看，招行发展也不错，前年税后利润13亿，去年税后