长齐亚·哈克发动军事政变，并对巴基斯坦实行军管。阿里·布托也被送往穆里山监管了起来。

    7月28日，阿里·布托与其他被捕的人民党领导人一起被释放。但这不过是个假象罢了，哈克不会就此罢手。9月3日，阿里·布托再次被捕，这次的罪名是谋杀。贝·布托心里清楚，哈克是在想方设法要父亲的命。

    在父亲被关押的这段时间，贝·布托替代他成为人民党的临时当家人，跟母亲一起迎战大选。在无数次的选举演讲中，贝·布托在牛津辩论社的所学都派上了用场，她生动**的演讲赢得了所到之处人民的支持。哈克千防万防都没防住贝·布托，气急之下，他下令逮捕了贝·布托。就是这次入狱之后，贝·布托的牢狱之灾就接连不断。

    与此同时，哈克控制的法庭开始审判阿里·布托。1978年3月，拉合尔最高法院宣布——阿里·布托被判死刑。

    听到这个消息，正被囚禁的贝·布托如遭雷击。父亲对于她来说是支柱，是精神寄托，在她眼里，父亲是教会自己飞翔的人，是把自己带领到政坛并悉心教导她的人，是慈父更是严师。当贝·布托从牛津大学回到巴基斯坦，一切对她来说还都需要重新开始，那些陌生的政治手段和政治策略需要有人来指导她学习，可是现在却一无所有了。贝·布托的全部热情和信心都来自于父亲，如今父亲眼看就要走到绝路，自己却无能为力，那种无助感比让她面对死亡更加恐怖。

    贝·布托不甘心，即便是政变者残忍地杀害了父亲她也绝不甘心让父亲的事业就此断送。于是，她忍受着耳病的折磨继续为父亲的事业而努力着。6月14日，贝·布托被释放，她接受了第一次耳病和鼻窦炎的治疗。身体还未完全康复，她便抓紧时间为营救父亲而奔波。