伯人为假想敌而设的城堡却在抵御荷兰人的入侵中发挥出巨大的作用。荷兰人曾于1600年前后三次攻入该岛，洗劫岛上的财产并焚毁一批建筑物，但从未攻陷城堡，这意味着该岛虽经历战火的洗礼却并未易主。多年后的今天，当一些史学家在评论这段风云变幻的海洋争战中称：若荷兰人攻入圣?塞巴士蒂昂城堡，驱逐葡萄牙人，占领莫桑比克岛，今日南非的开普顿城很可能并不存在。

    现在的城堡正门与整个建筑并不协调匹配，这是因为在1607一1608年荷兰人围攻莫桑比克岛时，为加固城堡的防卫能力而将原有的城门砌死。1712年，葡人把城墙上的一面窗户拆下，将其改建成城堡大门，一直沿用至今，而最早的正门在30多年前才被重新打开，因只有城墙的一半高度，遂被当成架在一条壕沟上的吊桥使用，现仍然依稀可辩。葡人在建造城堡时，设计了一项颇有智慧的创意并将其付诸实施，即把城内建筑物的顶部一律建成平面，专门用来收集雨水，然后通过引水渠导向城堡中央的水槽。这也是葡萄牙人在遭到长时间围攻时却能自救的一个重要原因，而荷兰人只有以海盗的身份从几公里外的海岸地带寻找或掠夺淡水资源，迎接他们的则是当地土著的仇视和反击。近年来，一家瑞士的国际救助组织出资铺设管道，将自来水从陆地引入莫桑比克岛，从而解决该岛居民的供水难题，而岛上的Capulanaclad妇女在用水紧张时，就会沿袭古老的生活习惯，每天来此取水，然后用头顶回，并称她们饮用的仍是500年前的淡水。