都尉李肃，率领敢死队秦谊、陈卫等穿上警卫服装，藏身宫门内，准备突击谋刺的行动。

    董卓洋洋得意乘车入宫门，心理上毫无这方面的戒备。李肃待其近拢，立刻奔出，以长戟刺之。不料董卓早有在官服内着甲的习惯，故而戟未刺入，只伤及手臂处。

    董卓大惊，摔到车下，大声叫喊：“吕布何在?”

    吕布奔上前来，大声喊道：“奉皇帝诏书，诛杀逆贼!”

    董卓万没料到吕布会如此，无比恼怒，大骂道：“我待你如子，竟然造反，如此忤逆，必遭凶报……”

    然而，话未说完，吕布的铁矛已经刺入了董卓咽喉。

    敢死队一拥而上，斩下了董卓的首级。

    董卓被杀的消息传开，宫廷内外，一片欢呼。长安城内，如同过节，街头巷尾张灯结彩，欢歌阵阵。另一方面，吕布等乘胜追击，将董卓弟董祀及董氏亲属和亲信等，一概诛杀。

    王允更下令追剿董卓余党，司隶区的各军团间立刻呈现非常紧张的状态。

    吕布军团倒戈及董卓政权被推翻，使司隶军区及长安城内的文武百官及军士，甚至从洛阳被强迫迁来的百姓，和长安原住居民都欢声震动。董卓肥胖的身子被暴露在街上示众，守尸体的士兵，更将董卓肚脐剖开，插入棉灯芯，以其肚子脂肪为油点灯，竭尽侮辱之能事。

    汉献帝去了董卓的胁迫和压制，也大大的扬眉吐气了。他立即论功行赏，任命王允为录尚书事，任命吕布为奋威将军，封为温侯。仆射士孙瑞说他并无什么功劳，把所有封赏都辞去了。王允和吕布共同管理朝政，一文一武，辅佐汉献帝。他们追查董卓一党的人，有的处死，有的充军。

    左中郎将蔡邕毕竟曾受过董卓的解救之恩，并且董卓一直对他很好，出于这样一种感激之情，去董卓暴尸之处祭悼了董卓。王允知道了这事，大骂蔡邕：“董卓乃逆贼，再不处死，汉室将亡。今将其处死，是大快人心之事，你身为朝廷大臣，且又是国内名士，应当深明大义才对。却反而逆反民意，往悼其贼，难道你真是董卓的死党吗?”

    蔡邕当然深明大义，对王允说：“我虽不才，但也知大理，董卓专横，扰乱朝政，罪在当诛。我只是念在私人交情，情感上过不去，故而往悼。如果认为我因此有罪，我不推诿，只求宽罚，饶我一回。”

    王允却将蔡邕交给廷尉处理。太尉马日禅知道蔡邕这一去必然凶多吉少，便向王允替蔡邕说情，他说：“蔡邕切不可死啊，他很有学问，又正在写汉朝历史。”

    王允摇头道：“前汉武帝不杀司马迁，让他著书，他却借题发挥，毁谤朝廷。现今皇上年轻，若让蔡邕这样的心存异志者继续耍笔，恐怕我们都要被他骂了……”

    马日禅只得叹气，蔡邕便在监狱里给逼死了。